Walka ze spamem służy również poszukiwaniu szczepionki przeciwko AIDS

Aby uczestniczyć w walce z AIDS, Microsoft opracował udostępnił swoje moce obliczeniowe oraz narzędzia analizy do badań prowadzonych w Republice Południowej Afryki, przy pomocy programu PhyloD. Celem jest przestudiowanie całek masy danych i wyciągnięcie z nich cennych lekcji na temat mutacji wirusa HIV. Okazuje się, że wirus ten przypomina nieco spam...

Każdego roku, 1 800 000 ludzi umiera z powodu AIDS, czyli około 5 000 dziennie. Aktualnie jest prowadzonych wiele projektów badawczych, które mają na celu znalezienie szczepionki. Pośród tych projektów, jeden otrzymał wsparcie firmy Microsoft Research, w analizowaniu i interpretowaniu danych zebranych w bardzo krótkim czasie.

Chodzi o eksperyment prowadzony w Durbanie, w Republice Południowej Afryki, przez badaczy z instytutu Ragon Institute z Massachusetts General Hospital MIT, z Uniwersytetu Harvard,  a także z uniwersytetu KwaZulu-Natal.

Spędziliśmy ostatnie dziesięciolecie na budowaniu tutaj infrastruktury, która pozwala nam badać w laboratorium mechanizmy obrony ciała na podstawie próbek krwi pacjentów, wyjaśnia dyrektor instytutu Ragon Institute, Bruce Walker, profesor medycyny na uniwersytecie KwaZulu-Natal.

Wyzwanie, z którym konfrontują się badacze, jest ogromne: ilość danych zebranych w trakcie prac przygotowawczych imponuje. Wirus HIV stale mutuje, aby oszukać ataki układu odpornościowego. Aby mieć jakieś pojęcie na temat tego zjawiska, mówimy, że wirus HIV może mutować u jednej zarażonej osoby tyle razy co wirus grypy zmutował od czasu jego indentyfikacji.

Analiza wirusa ma więc na celu odkrycie jego słabego punktu, aby opracować skuteczną sczepionkę. A taka analiza wymaga przestudiowania i zinterpretowania ogromnej ilości danych. I to tutaj na scenę wchodzi Microsoft. Ze swoją techniką anty-spam.

Wygrane lata z programem PhyloD

Zanim zacząłem pracować nad wirusem HIV, pracowałem nad filtrowaniem spamu i wymyślilem antyspamowy filtr, wyjaśnia David Heckerman z Microsoft Research. Pierwsza rzecz, jaka się okazała, to fakt, że spamerzy zaczęli próbować obejść nasz filtr, tak jak wirus HIV robi z układem odpornościowym. A to nam dało pomysł, w jaki sposób możemy zaaplikować nasze techniki.

I tutaj właśnie narodził się program PhyloD, eksplorujący dane biologiczne, który pozwala na analizowanie specyficznych komórek, w celu sklasyfikowania wirusa. Zasady stosowane w celu zwalczania spamu w programach komunikacyjnych Microsoft (Hotmail, Outlook, Exchange) służą również do zwalczania AIDS, podkreśla gigant amerykański.

Dzięki swojemu algorytmowi, program PhyloD zbiera fragmenty wirusa, które są podatne na ataki układu immunitarnego. Wyciąga z nich kompleksowe modele, które pozwalają zrozumieć w jaki sposób różne układy odpornościowe reagują na mutacje wirusa. Jest to niezbędny warunek do opracowania szczepionki.

Microsoft otrzymuje dane wysyłane przez zespół z Ragon Institute w Durbanie i przetwarza je w jednym ze swoich centrów obliczeniowych. To, co zazwyczaj jednej maszynie zajęłoby całe lata analiz i interpretacji, tutaj jest przetwarzane przez tysiące komputerów pracujących jednocześnie w ciągu kilku dni. Wygrany czas jest więc imponujący.

Wszystko, czego się dowiadujemy badając wirusa HIV wyjaśnia nam, w jaki sposób układ immunitarny funkcjonuje i ponosi klęskę. Wszystko, czego się tutaj dowiadujemy, znajdzie zastosowanie nie tylko w przypadku wirusa HIV, ale również raka piersi, raka prostaty, na przykład. Zmieni to sposób w jaki praktykujemy medycynę, ocenia Bruce Walker.

Bardzo wierzę w to, że chodzi o problem, który jesteśmy w stanie rozwiązać. Wiele osób poświęciło na to swoje kariery, a my będziemy pracować tak długo, aż nam się uda, zapewnił jeszcze dyrektor instytutu Ragon Institute.